秘密結社マフティー・ナビーユ・エリンがアナハイム・エレクトロニクスに秘密裏に発注した大型ＭＳ。Ξ（クスィー）という名称はνガンダムを引き継ぐ意図で付けられている。
サイコミュ兵器を搭載し、ミノフスキーエンジンを搭載している。これにより、擬似反重力推進を可能とし、地上でも従来のＭＳのようにＳＦＳに頼らずとも素早い移動が可能である。
月での最終調整を終え、隕石に偽装したカーゴ・ピサによって南太平洋上に降下。そのまますぐにキルケー部隊のペーネロペーと交戦している。
補給地を経由し、中央閣僚会議の開かれるオーストラリアアデレードを攻撃するためエアーズ・ロックへ移動。アデレードの攻撃に参加し、成功させている。
仲間を無事にアデレードがら退避させるため、再度アデレードに攻撃をしかけるがペーネロペーと戦うことになる。そして、キルケー部隊のしかけたバリアーにかかり、電気ショックにより電気系統が破損。しかし、コクピット周辺の装甲が厚かった為、パイロットは無事であった。
数々のガンダムを見てきたブライト・ノア艦長はΞを見たときに、「マシンとして複雑すぎる」とあまりいい印象は受けなかったようだが、Ξに「ガンダム」の名称がついたことには納得していたようである。
サナリィー（海軍戦略研究所の略称）が「Ｆ（フォーミュラー）計画」により開発した高性能小型ＭＳ。開発には旧ホワイト・ベースのクルー、ジョブ・ジョンが関わっている。
極限までに小型軽量化されたことにより、従来のＭＳに比べて１．５倍の出力を持ち、小型のジェネレーターが２機搭載されている。
標準装備はバルカン砲やビーム・サーベルといった極標準的なものだが、ミッションバック方式を採用しているため、用途に応じてさまざまなオプションが用意されており、２６種類もの性格の異なるＭＳとなることができる。しかし、そのためには大処理能力が可能なコンピュータが必要になった。ガンダムＦ９０は２機存在し、１号機には「ＴＹＰＥ Ａ・Ｒ」、２号機には「ＴＹＰＥ Ｃ・Ｒ」の擬似人格コンピュータが搭載されている。
実験訓練中に火星独立ジオン軍（通称オールズモビル）の攻撃を受け、２号機を強奪される。１号機は２号機を追って火星へ。火星ではオールズモビル仕様となったＦ９０ ２号機と戦うこととなったが、辛くも１号機が勝利する。
２号機は回収され大幅な改修を受けることとなる。そして、バイオ・コンピュータが搭載されたＦ９０Ⅱ ガンダムＦ９０Ⅱとなった。
Ｆ９０データ
頭頂高：１４．８ｍ
本体重量：７．５ｔ
全備重量：１７．８ｔ
ジェネレータ出力：３１６０ｋｗ
スラスター推力：７４７６０ｋｇ
アポジモーター数：５１
装甲材質：ガンダリウム合金セラミック複合材
標準武装：６０ｍｍ頭部バルカン×２ ビームライフル ビームサーベル×２
シールド
オプション武装：各運用仕様によりフォーマット化可能
アナハイム・エレクトロニクス社が「ＳＦＰ（シルエットフォーミュラプロジェクト）」により、非合法に入手したサナリィーの資料を元に開発されたガンダムタイプのＭＳ。
姿形はＦ９１に酷似しているが、技術的にはサナリィーに遅れをとっており、ヴェスバーやビームシールドのノウハウも不足していた。バイオ・コンピュータも未完成なため、高性能教育型コンピュータを搭載することでパイロットの負担を軽減しようとしている。シルエットガンダムはデータ収集用であるため戦闘には不向きであったが、総合的にはＦ９１と互角の性能を持つにいたった。
月の裏側に位置するゼブラゾーンにおいて試験稼動を行っていた際に、クロスボーン・バンガードの実験部隊と戦闘になる。さらに、連邦軍戦艦エイジャックスとの争いにも巻き込まれ、機体各所を破損する。
しかし、月のアナハイム工場で修復及び改修が行われ、ＲＸＦ－９１Ａ シルエットガンダム改として蘇ることになる。この機体は出力が向上され、ヴェスバーも新型に換装され、試験的にバイオ・コンピュータが搭載されている。
ＲＸＦ－９１データ
頭頂高：１５．４ｍ
本体重量：８．５ｔ
全備重量：２１．７ｔ
ジェネレータ出力：４５７０ｋｗ
スラスター推力：１１２０００ｋｇ
アポジモーター数：５０
装甲材質：ガンダリウム合金セラミック複合材
固定武装：６０ｍｍ頭部バルカン砲×２
オプション武装：メガマシンキョノン×２ ヘビーマシンガン×２
ビームサーベル×２ ヴェスバー×２ ビームシールド×２ ビームライフル
ビームスプレーガン
｢ＳＦＰ」で得られた技術に、今までのガンダムタイプのコンセプトを導入し完成させたアナハイムのガンダムタイプＭＳ。この機体にはコア・ブロックシステムが採用され、パイロットの生還率向上と実用データの回収に一役かっている。
武装面では、Ｇ－バードと呼ばれる大型ビームライフルを装備しているが、これはヴェスバーの技術から生まれた機動力を備えたビーム兵器であり、その威力は一撃で戦艦を沈めるほど強力である。
ネオ・ガンダムは２機製造されているが、１号機にはクロスボーン・バンガードのラフレシアに搭載されていたネオサイコミュシステムが組み込まれていたと言われている。
１，２号機共に連邦軍戦艦エイジャックスに配備される。ゼブラゾーンにおいて、Ｃ・Ｖやアナハイム試験艦ブレイウッドとの戦闘の際に、１号機、２号機のネオ・ガンダム同士の戦闘になる。２号機側にシルエットガンダムが味方して、ＭＳ部を犠牲にして１号機を撃破している。
ＲＸ－９９データ
頭頂高：１５．１ｍ
本体重量：７．９ｔ
全備重量２０．７ｔ
ジェネレータ出力：４７１０ｋｗ
スラスター推力９５２００ｋｇ
アポジモーター数：４６（８）
装甲材質：ガンダリウム合金セラミック複合材
固定武装：６０ｍｍ頭部バルカン×２
オプション武装：Ｇ－バード ビームサーベル（ビームガン）×２
ビームバルカン ビームシールド
「F計画」における集大成といえるMSであり、コア・ブロックシステムを採用している。コア・ブロックシステムの導入にはF９０の強奪事件や、アナハイムの「SFP」に対する企業としての秘密保持の面が強い。
武装面ではF９０同様にミッションパック方式の装備変更が可能であり、ビームシールドには新技術が導入され、機体から分離してもある程度稼動できるようになっている。この機体はF９０サードとも呼ばれ、形式番号のYは未知なる番号であるＸＹＺのうち２番目であることを示している。このことは、Ｘ、Zと表に出ない機体が存在していることを表している。
フロンティアⅠの暗礁空域でC・Vの警備隊と交戦になり、その後脱出したことが伝えられている。
パイロットはウォルフ・ライル。
Ｆ９０ＩＩＩＹデータ
頭頂高：１５．０ｍ
本体重量：７．９ｔ
全備重量：２０．７ｔ
ジェネレータ出力：４５５０ｋｗ
スラスター推力：６４０４０ｋｇ
アポジモーター数：４６
ハードポイント数：１０
ウェポンラック数：１
装甲材質：ガンダリウム合金セラミック複合材
固定武装：６０ｍｍ頭部バルカン×２
オプション武装：ビームバルカン×２ ビームサーベル×２ ビームシールド
ビームライフル メガビームバズーカ×２
サナリィーが「現時点でのＭＳ限界性能の達成」を目標に開発されたガンダムタイプＭＳ。連邦軍が要請した条件をクリアしており、現時点における最強のＭＳと言っても過言ではない。
ＭＣＡ構造（マルチブル・コントラクション・アーマー）を取り入れており、装甲には耐弾性の他にステルス性も備わっている。小型で高出力なジェネレーターが搭載されており、ヴェスバーやビームシールドといった強力な兵器を標準で装備することができた。しかし、機体が高性能すぎるため、一般のパイロットでも扱えるようにバイオ・コンピュータによりリミッターが設えられている。パイロットが機体を十分に扱えるとバイオ・コンピュータが判断した際には、頭部のフェイスガードが左右に割れ、金属剥離効果が発生する。これは、機体の輪郭とある程度の残像を残すため、ガンダムＦ９１が分身したように見える。これにより、レーダーによる策敵装置だけでなく、パイロットの肉眼をも惑わすことが可能である。
Ｃ・Ｖのフロンティアサイド攻撃の際に、フロンティアⅠに居た連邦軍の練習艦スペースアークに運び込まれる。バイオ・コンピュータを作動させることに成功させ、レジスタンス側の戦力として戦闘に投入される。ラフレシア戦では、ビギナ・ギナが撃破されセシリィーが宇宙に投げ出されるのを見ると、シーブックがＦ９１のリミッターをはずし、「分身」を利用して中破しながらもラフレシアを撃破している。その後、バイオ・コンピュータを利用して宇宙に投げ出されたセシリィーを見つけ出している。フロンティアⅠ脱出後はＣ・Ｖ崩壊まで戦い続けたと言われている。
後年少数ながら量産され、ハリソン大尉の部隊に送られている。
Ｆ９１データ
頭頂高：１５．２ｍ
本体重量：７．８ｔ
全備重量：１９．９ｔ
ジェネレータ出力：４２５０ｋｗ
スラスター推力：６２１２０ｋｇ
アポジモーター数：５１（８）
装甲材質：ガンダリウム合金セラミック複合材
固定武装：６０ｍｍ頭部バルカン×２ ヴェスバー×２ ビームサーベル×２
胸部メガマシンキャノン×２
オプション武装：ビームシールド ビームライフル ビームランチャー